Unidade São Francisco do Sul
Localizada às margens da Baía da Babitonga, a Unidade de São Francisco do Sul tem uma infraestrutura completa para as ações desenvolvidas para o curso de Biologia Marinha e cursos da área de Ciências Sócioeconômicas. Na Vila da Glória, situada na área continental do município, está instalado o Centro de Estudos e Pesquisas Ambientais (CEPA).